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玉皇心印妙经注
此玉帝传心，圣圣相承，以心印心，明悟了证，皆宗此旨。三教莫违，故云心印。
上药三品，
最上妙药有三品，即三般。
神与气精。
非金石上术，灵芝玉屑，及外药凡药，乃元神、元气、元精。凡药可以愈疾，所及有限。此药保劫度世，化济无穷，一切莫此，故云上药。
恍恍
似有非有。
惚惚，
似无非无。
杳杳
似远非远
冥冥。
似近非近，若不见闻，似有见闻。
存无守有，
秘存虚无，默守妙有。
顷刻而成。
上药一得，立跻圣域。
回风混合，
回旋巽风，混合百神。
百日功灵。
三月基就，功渐玄灵。
默朝上帝，
宇泰贞定，秘礼元皇。
一纪飞升。
十二年丹神飞升。一云历脱十二相属乃升。
知者易悟，
真知者易悟上药之基。
昧者难行。
愚昧者难行存守之义。
履践天光，
宇泰定，天光发，而足蹑天根。
呼吸育清。
真炁往来，滋育玄清。
出玄入牝，
知天谷元神，而出玄入牝。
若亡若存。
不散亡，不强存，若亡若存。
绵绵不绝，
默默绵绵，终始不绝。
固蒂深根。
性根命蒂，妙培深固。
人各有精，
各人皆有至真真精。
精合其神。
真精妙合元神。
神合其气，
元神妙合真气。
气合体真。
元气妙合吾体至真。
不得其真，
不得身之至真。
皆是强名。
自云得药，便是强名。
神能入石，
神入金石无碍。一云穿山透石无不到之谓也。
神能飞形。
炼神还虚，身自飞升。
入水不溺，
有道者水不漂溺。一云诸欲不染为不溺。
入火不焚。
有道者火不能焚。一云怒妄不生为不焚。
神依形生，
形成而神至，故云神依形生。
精依气盈。
气满则精全，故云精依气盈。
不凋不残，
神气精全，系无耗散，而不凋不残。
松栢青青。
永无衰变，如松栢青青。
三品一理，
三品上药，共根一理。
妙不可听。
重玄至妙，非可闻听。
其聚则有，
善存默守，妙聚则有。
其散则零。
妙意涣散，倏忽凋零。
七窍相通，
耳目鼻口真七窍，内为相通，一云，七窍在内。
窍窍光明。
风云发泄，窍窍光明。一云，各有天光宝明。
圣日圣月，
身之真阴真阳，永明不毁，故云圣日圣月。
照耀金庭。
光映丹台紫府，云照耀金庭。
一得永得，
真得实益，永不毁沦。
自然身轻。
身轻回阳换骨还虚，非徒体健也。
太和充溢，
太和真气，充满洋溢。
骨散寒琼。
黄中通理，骨竦神怡，毕落琼琳，金筋玉骨。
得丹则灵，
明药得丹，易凡而灵。
不得则倾。
不得正丹，梁丧身倾。
丹在身中，非白非青。
非肺白，非肝青。
诵之万遍，
默转真经万遍，非口诵也。
妙理自明。
此经妙理，召然明白。
无上玉皇心印妙经注竟
回向忏悔文
回心向道，重诚忏其前愆，悔而自新，不作后过。
龙章凤篆，已殚尽也歌咏之诚；鹤驾鸾舆，重冀望也鉴观之惠。臣谨炷真香，丹诚天香也。重诚奏启道经师宝，元始万神，玉光会中一切圣真。恭望恩光，重垂证鉴。臣向来为某人某事看诵《玉皇本行集经》几部，敬保某人某事云云万所宣经典，罔敢不虔。其柰业力障魔，神志错乱，所立根钝，自然想来，脱略混淆，颠倒重迭，临文徇意，字误句差。乖清浊之正音，泥解会之邪见。事夺其志，心不在经。问对起居，断绝隔越。久诵懈怠，因事忿嗔。严洁或涉於垢尘，肃敬或乘以渎慢。身口服用之不净，衣冠礼貌之不虔。供弗如仪，处非其地，卷舒揉乱，坠落脱伤。不专不恭，大惭大愧。伏愿慈悲怜悯，赦释罪愆，庶使诵持得臻感格。所祈所愿，如志如心。尚虑经中传授或误，刊写多讹。其师其人，悉皆忏悔。仗道威力，愿罪消除，常转法轮，普度群品。为如上众，稽首称念太上无极大道，至真三十六部尊经、真文宝符，太上三尊、十方众圣、玄中大法师。玉经中无鞅数众神仙，不可思议功德。
高上玉皇本行集经忏悔文竟
译《玉皇心印妙经注》这是玉帝传授心法，历代圣人圣人相承，以心印证于心；凡是明悟并证得的，都以此宗旨为宗。三教都不可违背，所以称为“心印”。上等药物有三品。最上等的妙药有三品，也就是三种。就是神、气、精。不是金石之类的外丹术、灵芝玉屑以及外药、凡药，而是元神、元气、元精。凡药可以治愈疾病，但所能达到的范围有限；这种药可以保全劫运、度脱世人，化育救济而无穷尽，一切药物都比不上它，所以称为“上药”。恍恍然。好像存在，却又不是实有。惚惚然。好像不存在，却又不是全无。杳杳然。好像遥远，却又并不遥远。冥冥然。好像接近，却又并不接近；似乎看不见、听不见，却又好像有所见闻。存无而守有。秘密存守虚无，默默守持妙有。片刻之间便可成就。上药一旦得到，立即登入圣境。回风混合。回旋巽风，使百神混合。一百日便功效显灵。三个月根基形成，功效逐渐玄妙灵验。默默朝拜上帝。宇内安泰而贞正安定，秘密礼敬元皇。一纪之后飞升。十二年后丹神飞升。另一说认为，经历十二个属相的年数后便飞升。有真知的人容易领悟。真正知晓的人，容易领悟上药的根基。昏昧的人难以实行。愚昧的人难以实行存守的道理。践履天光。宇内安泰而安定，天光发出，于是脚踏天根。呼吸以养育清气。真炁往来运行，滋养培育玄清之气。从玄门出入牝门。知晓天谷中的元神，于是从玄门出入牝门。若亡若存。不使它散失，也不强行存守，任其若亡若存。绵延不断。默默绵绵，始终不断绝。巩固根蒂，深扎根基。性根和命蒂得到精妙的培育，深厚而坚固。每个人都有精。每个人都有至真之精。精与神相合。真精与元神精妙地相合。神与气相合。元神与真气精妙地相合。气与身体的真性相合。元气与我的身体和至真精妙地相合。不能得到其中的真。就是不能得到身体中的至真。全都是勉强的称说。自称已经得到药，便只是勉强的称说。神能够进入石中。神进入金石而无所阻碍。另一说认为，这是说穿山透石，无处不能到达。神能够使形体飞升。炼神还虚，身体自然飞升。进入水中而不沉溺。有道之人不会被水漂荡淹没。另一说认为，各种欲望都不能沾染自身，称为“不溺”。进入火中而不被焚烧。有道之人不会被火焚烧。另一说认为，愤怒和妄念不生，称为“不焚”。神依附形体而产生。形体形成，神便到来，所以说“神依形生”。精依赖气而充盈。气充满，精便完足，所以说“精依气盈”。不凋败，不残损。神、气、精完足，没有耗散，因此不凋败、不残损。像青松翠柏一样常青。永远不衰败变异，就像青松翠柏常青。三品同一根理。三品上药共同根源于同一个道理。妙理不可听闻。重玄之道极其玄妙，不是耳朵所能听闻的。聚合时便存在。善于存守，妙理聚合时便会显现存在。散开时便零落。妙意涣散，顷刻之间便凋零。七窍彼此相通。耳、目、鼻、口是真正的七窍，内在彼此相通。另一说认为，七窍在体内。每一窍都光明。风云之气发散流泄，每一窍都光明。另一说认为，各窍都有天光宝明。圣日，圣月。身体中的真阴、真阳永远光明而不毁坏，所以称为“圣日、圣月”。照耀金庭。光芒映照丹台、紫府，所以说照耀金庭。一旦得到，永远得到。真正得到实际的益处，永远不会毁坏沉沦。自然会身体轻快。所谓身轻，是回阳、换骨、还虚，并不只是身体健康。太和之气充满洋溢。太和真气充满而洋溢。骨骼散发寒琼之气。黄中之气通达内理，骨骼挺立而精神愉悦，污秽尽皆脱落，成为金筋玉骨。得到丹便灵验。明白药理并得到丹，便能由凡转灵。得不到便倾覆。得不到正丹，根基丧失，身体倾覆。丹在身体之中，不是白色，也不是青色。不是肺的白色，也不是肝的青色。诵读一万遍。在心中默默运转真经一万遍，并不是用口诵读。妙理自然明白。这部经的妙理便昭然明白。《无上玉皇心印妙经注》完。回向忏悔文。回转自己的心而归向大道，以更加真诚的心忏悔以前的过错，悔改而自我更新，不再犯以后的过失。龙章凤篆，已经竭尽我们歌咏的诚心；鹤驾鸾舆，再次寄望于鉴察观照的恩惠。臣谨慎地点燃真香，这是以丹诚奉上的天香。臣以更加真诚的心，奏告启请道经师宝、元始万神以及玉光会中的一切圣真。恭敬地祈望恩光，再次垂示鉴察。臣先前因为某人某事，诵读《玉皇本行集经》若干部，恭敬地为某人某事祈求保佑，以上所宣读的经典，丝毫不敢不虔诚。无奈业力和障魔所阻，神志错乱，所立根基迟钝；自然会产生杂念，以致遗漏、混淆、颠倒、重复，临读经文时任意顺从自己的意思，造成字误句错。违背清浊的正音，拘泥于错误的理解和邪见。事情夺去了心志，心思不在经文上；问答和起居之事，使诵经断绝隔离；久诵之后产生懈怠，又因事情而生忿怒嗔恨。严肃洁净之时，有时沾染了污垢尘埃；肃敬之时，有时又流于亵渎怠慢。身体、口舌以及所用物品不洁净，衣冠礼貌也不虔诚。供品不合仪式，处所也不适当；经卷展开、收卷时受到揉乱，甚至坠落而脱落破损。既不专心，也不恭敬，实在惭愧至极。伏愿诸圣慈悲怜悯，赦免释放这些罪过，使诵持经典能够达到感通圣真的境界。所祈求、所愿望的，都能如同心志、心愿。还担心经中传授或有错误，刊刻抄写也多有讹误。对于传授的师者和诵经之人，愿一并忏悔。愿凭借大道的威力，使罪过消除，常常转动法轮，普遍度脱众生。为上述众人，稽首称念太上无极大道、至真三十六部尊经、真文宝符、太上三尊、十方众圣、玄中大法师，以及《玉经》中无数的神仙和不可思议的功德。《高上玉皇本行集经忏悔文》完。